Получение дейтерий-меченных аминокислот и их масс-спектрометрический анализ
.
Данные по росту штамма B. methylicum и максимальному уровню накопления фенилаланина в культуральной жидкости на средах с 2 об.% СН3ОН (СD3OD), содержащих ступенчато увеличивающиеся концентрации D2O представлены в таблице 1. Как видно из данных таблицы, рост исследуемых бактерий на средах с возрастающими концентрациями тяжелой воды сопровождался изменением выходов биомассы, времени клеточной генерации и продолжительности лаг-фазы при сохранении способности синтезировать и накапливать фенилаланин в культуральной жидкости. Поэтому было необходимо изучить, как изменяются степени включения дейтерия в фенилаланин и аминокислотные остатки суммарных белков биомассы B. methylicum в этих условиях.
ТАБЛИЦА 1.
Влияние изотопного состава среды на рост штамма B. methylicum и уровень накопления L-фенилаланина в культуральной жидкости.
|
Номер Компоненты среды, об% Величина Выход Время ген. опыта лаг-фазы биомассы часы секреции Н2О 2Н2О СН3ОН С2Н3О2Н часы % L-Phe, | ||||||||
|
1 |
98 |
0 |
2 |
0 |
24,0 |
100 |
2,2 |
100 |
|
2 |
98 |
0 |
0 |
2 |
30,3 |
92,3 |
2,4 |
99,1 |
|
3 |
73,5 |
24,5 |
2 |
0 |
32,1 |
90,6 |
2,4 |
96,3 |
|
4 |
73,5 |
24,5 |
0 |
2 |
34,7 |
85,9 |
2,6 |
97,1 |
|
5 |
49,0 |
49,0 |
2 |
0 |
40,5 |
70,1 |
3,0 |
98,0 |
|
6 |
49,0 |
49,0 |
0 |
2 |
44,2 |
60,5 |
3,2 |
98,8 |
|
7 |
24,5 |
73,5 |
2 |
0 |
45,8 |
56,4 |
3,5 |
90,4 |
|
8 |
24,5 |
73,5 |
0 |
2 |
49,0 |
47,2 |
3,8 |
87,6 |
|
9 |
0 |
98,0 |
2 |
0 |
60,5 |
32,9 |
4,4 |
79,5 |
|
10 |
0 |
98,0 |
0 |
2 |
64,4 |
30,1 |
4,9 |
71,5 |
Для определения степени включения дейтерия в аминокислоты методом масс-спектрометрии электронного удара использовали метиловые эфиры дансил-аминокислот, которые химически стабильны и дают интенсивные пики молекулярных ионов в масс спектрах [13]. В качестве примера на рис.1 показана фрагментация метилового эфира дансилфенилаланина при электронном ударе. В масс-спектрах этого производного, как правило, четко детектируется пик молекулярного иона метилового эфира дансилфенилаланина М+. с m/z 412. Пик аминного фрагмента А имеет невысокую интенсивность, а пик аминоацильного фрагмента В крайне низкую или вообще отсутствует (см. рис. 1). Интенсивности пиков аминных А и аминоацильных В фрагментов других производных аминокислот, например присутствующих в культуральной жидкости аланина, валина и лейцина (изолейцина) при электронном ударе также сопоставимы. Кроме вышеобозначенных пиков, в масс-спектрах электронного удара метиловых эфиров дансил-аминокислот фиксируются пики с m/z 250, 234, 170, которые соответствуют дансильному фрагменту и продуктам его распада до N-диметиламинонафталина.
Прочие статьи:
Стайное поведение.
В группах второго типа иерархия и доминирование обычно отсутствуют. Животные держатся вместе в силу инстинкта стайности. Если иерархические группы можно наблюдать почти у всех классов позвоночных, то стаи без доминирования в основном име ...
Эндомикориза
Основное отличие эндотрофной микоризы в том, что гифы гриба проникают в клетки коры корня (через поры, не проходя сквозь плазмалемму). На поверхности корня микориза выражена слабо, то есть вся основная часть гриба находится внутри корня. ...
Хромосомная локализация
Классическое генетическое картирование основывается на получении определенных мутаций и анализе частот рекомбинаций. У Drosophila генетические карты удалось расширить и уточнить путем установления корреляций между генетическими данными и ...